Olá, tudo bem? Espero que tudo ótimo.
Segue passo-a-passo para unir dois produtos em um só (note que é uma solução paleativa até criarmos a opção de composição, que fará esse processo de maneira correta e automática). Faça todo o processo com cuidado e atenção!
O primeiro passo é dar entrada no estoque de maneira correta. Relacionando os produtos individuais que comprou do seu fornecedor. Não esqueça de ter o cadastro dos produtos individuais e o cadastro do kit (que no caso) é a união dos produtos dentro de administativo > produtos.
Feito isso, será necessário redirecionar o estoque, vá então em Administrativo > Estoque.
Agora, é necessário começarmos a transferência. Para isso, vou citar um exemplo: Vou unir uma cesta, onde tenho a cesta de maneira em si, e os chocolates que vão dentro dela.
Nesse exemplo, quero transformar o chocolate e a cesta de maneira em uma cesta de presente. Então, vamos clicar no botão Transferência de estoque entre produtos:
Fazendo com que a cesta de maneira, seja transferida para a cesta de chocolate. Lembre-se de colocar a quantidade correta.
Após isso, vamos transferir o chocolate:
Ficando assim. Uma vez que fizemos essa junção, o estoque tanto do chocolate, quanto da cesta de maneira serão decrementados, e adicionados na quantidade da cesta de chocolate.
Agora, será necessário fazermos um ajuste técnico para essa quantidade, uma vez que a quantidade será alterada para 1 (já que a composição de um chocolate e uma cesta de madeira formam um produto cesta de chocolate).
Para esse processo, altere a quantidade, pressionando e segurando o produto cesta de chocolate para colocar a quantidade 1, nesse exemplo. 
Prontinho! A união está feita e você poderá emitir nota.
Nota: O mais importante desse processo é a união (juntar) em um produto só para que o sintegra e outros, entendam esse processo.
Espero que esse artigo tenha ajudado! Até mais!